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科學家開發出能有效區分細胞中新舊基因轉錄物的新方法

2020-03-10 08:52來源:生物谷


一項刊登在國際雜志Science上的研究報告中,來自胡布勒支研究所等機構的科學家們通過研究開發了一種新方法,來評估基因轉錄物的產生和降解是如何被調節的,研究者發現,細胞能利用不同的策略來控制轉錄物拷貝的數量,其是細胞正常發揮功能不可或缺的。

    

我們的機體由數萬億個含有相同DNA的細胞組成,盡管每個細胞中的DNA都是相同的,但有機體卻是由不同的細胞類型所組成,每一種類型的細胞都有著不同的功能,在不同的細胞類型中,DNA上不同類型的基因就會處于活性狀態,而不同的“配方”會被用來構建細胞的組分,這就能幫助確定細胞的類別,比如皮膚細胞或肌肉細胞等,為了完成這項任務,細胞就必須復制基因,即所謂的轉錄物,其會被用來制造蛋白。


細胞中每個基因轉錄物的數量能夠幫助測定基因的活性,這個數量會被制造的基因拷貝所影響,即轉錄的過程,破壞當前已經存在的基因拷貝(即降解)也會影響轉錄物的數量;在單一細胞中,通過破碎細胞就能測定轉錄物拷貝的數量,因此不能在同一細胞中隨著時間的推移進行追蹤。截至目前為止,研究人員并不清楚單一細胞中轉錄物的組合和降解是如何調節特殊轉錄物拷貝的數量的。


這項研究中,研究就開發了一種新型單細胞測序技術,其能有效將新制造的轉錄物和此前已經存在的轉錄物進行有效區分;通過將相關數據與計算機模型相結合,研究人員就發現,基因的轉錄和降解主要參與到了調節轉錄物的數量中去,研究者Battich說道,細胞似乎能夠利用不同的策略來調節基因的活性或其轉錄物拷貝的數量;對于某些基因而言,細胞不得不快速改變其拷貝數,而這些基因生來就會在高水平下被轉錄并降解,通過參與這些過程,細胞就會通過降低轉錄并同時增加降解來快速改變拷貝數。


最后研究者表示,這種名為scEU-seq的技術能被用來研究生物體多個過程,比如發育期間細胞的特殊化,健康和癌癥系統中細胞分類的調節機制等。