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開發出有望識別致癌病原體的新方法

2019-11-05 13:51來源:生物谷


近日,一項刊登在國際雜志Genome Biology上的研究報告中,來自東英吉利亞大學等機構的科學家們通過研究開發了一種新方法來尋找與癌癥相關的細菌和病毒。

    

如今研究人員已經發現,某些感染與癌癥發生直接相關,比如胃癌和宮頸癌等;這項研究中,研究者通過研究揭示了如何對來自腫瘤的基因組數據進行測序來揭示與其發生相關的細菌和病毒,相關研究結果或能幫助檢測致癌微生物,未來有一天或能幫助開發多種癌癥疫苗,比如HPV疫苗等。


研究者Dan Brewer博士說道,某些感染與癌癥發生存在明顯關聯,比如,消化道中幽門螺桿菌的存在就會引發胃潰瘍,并與胃癌發生直接相關;某些類型的HPV也會引發宮頸癌;隨著人類進入到基因組醫學時代,如今研究人員對人類組織進行全基因組測序的工作也越來越多,當對腫瘤樣本進行全基因組測序時,來自任何病原體的DNA也能夠被進行測序,這就有望幫助研究者檢測和定量病原體。


因此,研究人員就能利用所收集的數據來識別細菌、病毒和不同類型癌癥之間的關聯;文章中,研究人員開發了計算機模擬技術,當對真正的癌癥測序數據進行分析之前,其能對多種方法就進行驗證,并在這些數據中尋找一些有趣的病原體;在模擬實驗中,研究人員制造了包含大部分人類基因組序列的“模擬”基因組,同時還在其中加入了少量的病原體序列,而這正是研究人員希望在癌癥序列中所觀察到的。


當研究者在每一個模擬的基因組中發現病原體并對其進行定量分析后,他們就能夠檢測每一種方法是否可行;研究者除了發現與癌癥發生相關的病原體外,他們還能夠發現更多病原體,目前研究人員才剛剛開始研究確定這些病原體在癌癥發生過程中所扮演的關鍵角色。最后研究者Brewer表示,如今人們所注射的HPV疫苗能夠有效預防大約70%的宮頸癌病例,我們希望后期能夠通過更為深入的研究識別出與其它癌癥發生相關的細菌和病毒,從而開發出有效預防癌癥發生的新型疫苗。