環(huán)狀RNA有望作為癌癥生物標志物

隨著新技術(shù)允許科學家們深入研究基因組和外顯子組，一類新的稱為環(huán)狀RNA（circular RNA, circRNA）的RNA可能發(fā)揮著一種有趣的作用。

在一項新的研究中，來自美國密歇根大學的研究人員對多種癌癥中的circRNA進行了編目，并進行了初步研究，表明這些穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)可能作為血液或尿液中的癌癥生物標志物。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2019年2月7日的Cell期刊上，論文標題為“The Landscape of Circular RNA in Cancer”。

circRNA是一種非編碼RNA，它們形成閉合的環(huán)狀結(jié)構(gòu)而不是線性結(jié)構(gòu)。新的RNA測序方法曝光了這些circRNA，但是人們對它們起作用的原因或方式知之甚少。不過它們的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)使得它們成為癌癥生物標志物的理想候選對象。

這項新的研究確定了癌癥中的circRNA目錄，從而為未來的研究構(gòu)建了一個數(shù)據(jù)庫。論文共同通訊作者、密歇根大學轉(zhuǎn)化病理學中心主任Arul M. Chinnaiyan博士說，“我對circRNA作為非侵入性生物標志物的潛力感到非常興奮。鑒于它們的穩(wěn)定性，我們可能能夠在癌癥患者的血液或尿液中檢測到它們。這可能對癌癥的診斷或預后有用。”

作為MiONCOSEQ項目的一部分，這些研究人員從800多個腫瘤樣本中發(fā)現(xiàn)了circRNA。他們證實為MiONCOSEQ項目開發(fā)的捕獲RNA測序在檢測circRNA方面比現(xiàn)有方法更為強大。

Chinnaiyan說，“這種捕獲方法可能是有限的，這是因為它基于我們用來捕獲RNA的探針。但是，全外顯子組捕獲方法使得它具有重大的意義。我們通過這種方式捕獲大量的RNA。這就是為何我們能夠鑒定出如此多的之前并不知道的circRNA。”

這種技術(shù)僅需少量總RNA就能夠鑒定出circRNA。這意味著它們可能在RNA被稀釋的地方被檢測到，比如血液或尿液。

此外，這些研究人員還鑒定出幾種在前列腺癌組織中發(fā)現(xiàn)的circRNA。通過評估來自前列腺癌細胞的circRNA，他們發(fā)現(xiàn)它們比線性RNA更穩(wěn)定。它們也可在尿液樣品中檢測到。

Chinnaiyan說，“我們能夠證實這些circRNA存在于尿液中并且來自前列腺癌的circRNA可被檢測到。我們未來的研究將探究這些circRNA作為尿液或血液中的癌癥生物標志物。”

這些研究人員將他們的研究結(jié)果轉(zhuǎn)變?yōu)橐粋€名為MiOncoCirc的數(shù)據(jù)庫，這個數(shù)據(jù)庫對腫瘤樣本中報道的circRNA進行編目。這種資源可供科學家們使用，有助于開發(fā)新的癌癥生物標志物。