|
為什么新的致命性病毒很難被發(fā)現(xiàn)2020-03-27 11:32來(lái)源:生物谷
在最近發(fā)表的一篇文章中,由MIPT研究人員組成的俄羅斯研究團(tuán)隊(duì)是**系統(tǒng)地描述和總結(jié)了目前快速發(fā)展的病毒遺傳學(xué)領(lǐng)域的前沿技術(shù)。在過(guò)去的幾年中,已經(jīng)開(kāi)發(fā)出許多新的有效的病毒檢測(cè)方法,包括針對(duì)未知病原體的方法。作者將所謂的高通量下一代測(cè)序描述為一種有效的新方法。該方法有望徹底改變新的病原病毒的檢測(cè)和分析方法,但是將其引入主流臨床實(shí)踐至少要花費(fèi)數(shù)年的時(shí)間。 為了應(yīng)對(duì)COVID-19大流行的迅速蔓延,作者在《Virus》雜志上發(fā)表了有關(guān)識(shí)別和研究新興病原體(如冠狀病毒)的問(wèn)題的基本綜述。 MIPT歷史遺傳學(xué),放射性碳分析和應(yīng)用物理實(shí)驗(yàn)室的研究員,作者之一Kamil Khafizov說(shuō):“根據(jù)各種統(tǒng)計(jì)估計(jì),有超過(guò)32萬(wàn)種感染哺乳動(dòng)物的病毒。但是到目前為止,只有不到1%的物種得到了研究。”
大多數(shù)病毒,包括引起人類呼吸道,消化系統(tǒng)疾病和其他疾病的病毒,仍未得到人類的研究,因此幾乎無(wú)法檢測(cè)。其背后的原因是現(xiàn)代測(cè)試系統(tǒng)針對(duì)的病毒范圍較窄。 但是,有一些新方法可能潛在地解決了檢測(cè)和識(shí)別新微生物的問(wèn)題,并且本綜述探討了這些方法。作者認(rèn)為下一代測(cè)序(NGS)是最有前途的,它可以并行分析多個(gè)DNA分子,無(wú)論是一組樣品,同一基因組的不同區(qū)域,還是兩者都可以。 “高效的數(shù)學(xué)算法是該方法的關(guān)鍵部分,” MIPT博士生兼評(píng)論的通訊作者Alina Matsvay說(shuō)。 “它們使研究人員能夠?qū)⑽粗《镜幕蚪M與所有可用的病毒基因組參考進(jìn)行比較,并預(yù)測(cè)其所有可能的特征,包括其致病潛力。” NGS的主要缺點(diǎn)包括運(yùn)行此類測(cè)試所需的設(shè)備和試劑的高成本以及冗長(zhǎng)的樣品制備,測(cè)序和數(shù)據(jù)分析過(guò)程。這些限制,再加上對(duì)實(shí)驗(yàn)室人員資格的高要求,使得該方法無(wú)法廣泛集成到主流臨床實(shí)踐中。然而,該技術(shù)的成本逐年下降,而其速度,準(zhǔn)確性和效率卻在不斷增長(zhǎng)。 作者指出,冠狀病毒大流行已證明NGS方法對(duì)于鑒定臨床樣品中的新病原體和研究病毒從動(dòng)物向人類傳播的分子機(jī)制的重要性。該技術(shù)可能會(huì)在不久的將來(lái)獲得醫(yī)療保健方面的認(rèn)證。 |