為什么新的致命性病毒很難被發(fā)現(xiàn)

在最近發(fā)表的一篇文章中，由MIPT研究人員組成的俄羅斯研究團(tuán)隊(duì)是**系統(tǒng)地描述和總結(jié)了目前快速發(fā)展的病毒遺傳學(xué)領(lǐng)域的前沿技術(shù)。在過(guò)去的幾年中，已經(jīng)開(kāi)發(fā)出許多新的有效的病毒檢測(cè)方法，包括針對(duì)未知病原體的方法。作者將所謂的高通量下一代測(cè)序描述為一種有效的新方法。該方法有望徹底改變新的病原病毒的檢測(cè)和分析方法，但是將其引入主流臨床實(shí)踐至少要花費(fèi)數(shù)年的時(shí)間。

為了應(yīng)對(duì)COVID-19大流行的迅速蔓延，作者在《Virus》雜志上發(fā)表了有關(guān)識(shí)別和研究新興病原體（如冠狀病毒）的問(wèn)題的基本綜述。

MIPT歷史遺傳學(xué)，放射性碳分析和應(yīng)用物理實(shí)驗(yàn)室的研究員，作者之一Kamil Khafizov說(shuō)：“根據(jù)各種統(tǒng)計(jì)估計(jì)，有超過(guò)32萬(wàn)種感染哺乳動(dòng)物的病毒。但是到目前為止，只有不到1％的物種得到了研究。”

大多數(shù)病毒，包括引起人類呼吸道，消化系統(tǒng)疾病和其他疾病的病毒，仍未得到人類的研究，因此幾乎無(wú)法檢測(cè)。其背后的原因是現(xiàn)代測(cè)試系統(tǒng)針對(duì)的病毒范圍較窄。

但是，有一些新方法可能潛在地解決了檢測(cè)和識(shí)別新微生物的問(wèn)題，并且本綜述探討了這些方法。作者認(rèn)為下一代測(cè)序（NGS）是最有前途的，它可以并行分析多個(gè)DNA分子，無(wú)論是一組樣品，同一基因組的不同區(qū)域，還是兩者都可以。

“高效的數(shù)學(xué)算法是該方法的關(guān)鍵部分，” MIPT博士生兼評(píng)論的通訊作者Alina Matsvay說(shuō)。 “它們使研究人員能夠?qū)⑽粗《镜幕蚪M與所有可用的病毒基因組參考進(jìn)行比較，并預(yù)測(cè)其所有可能的特征，包括其致病潛力。”

NGS的主要缺點(diǎn)包括運(yùn)行此類測(cè)試所需的設(shè)備和試劑的高成本以及冗長(zhǎng)的樣品制備，測(cè)序和數(shù)據(jù)分析過(guò)程。這些限制，再加上對(duì)實(shí)驗(yàn)室人員資格的高要求，使得該方法無(wú)法廣泛集成到主流臨床實(shí)踐中。然而，該技術(shù)的成本逐年下降，而其速度，準(zhǔn)確性和效率卻在不斷增長(zhǎng)。

作者指出，冠狀病毒大流行已證明NGS方法對(duì)于鑒定臨床樣品中的新病原體和研究病毒從動(dòng)物向人類傳播的分子機(jī)制的重要性。該技術(shù)可能會(huì)在不久的將來(lái)獲得醫(yī)療保健方面的認(rèn)證。