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我國科學家發現胰腺神經內分泌腫瘤分子分型模型2019-11-07 11:20來源:生物谷
近日,由北京協和醫院趙玉沛院士領銜,北京協和醫院吳文銘團隊與深圳華大生命科學研究院吳逵團隊合作在Gut雜志上發表了題為Whole-genome sequencing reveals distinct genetic bases for insulinomasand non-functional pancreatic neuroendocrine tumours: leading to a newclassification system的研究論文,探究胰腺神經內分泌腫瘤(PanNET)主要臨床分型的基因組水平差異。通過合作研究,利用多組學測序測序技術,系統比較了胰島素瘤和非功能性小胰腺神經內分泌腫瘤(NF-PanNET)基因組水平差異,基于基因組拷貝數變異(CNV)及單堿基突變,提出了分子分型模型,并揭示CNV對NF-PanNETs預后的預測價值。
研究團隊對比胰島素瘤及NF-PanNET基因組數據,發現胰島素瘤和NF-PanNET呈現出不同的突變特征。且在CNV層面上,胰島素瘤主要以拷貝數中性和拷貝數擴增為主;NF-PanNET主要以拷貝數中性、拷貝數擴增和拷貝數缺失為主;并以此提出5種亞型的分子分型。 通過比較分子分型模型中不同亞型預后,提示拷貝數擴增、拷貝數缺失的NF-PanNET復發風險較高;同時,拷貝數擴增、拷貝數缺失的NF-PanNET中DAXX/ATRX基因突變比例較高,聯合拷貝數變化及DAXX/ATRX基因突變有助于更精準的預測NF-PanNET的復發風險和時機。 綜上,該研究對胰腺神經內分泌腫瘤不同臨床亞型的基因組變化進行了更深入研究,解釋了臨床分型與分子分型之間的關聯,提出了新的預后判斷指標,為該疾病機制的研究、臨床的精準治療提供了研究基礎。 |