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將多個基因錯誤識別為非蛋白編碼的

2018-12-18 09:24來源:生物谷


人類基因組包含編碼蛋白的區域,這意味著它們具有產生在體內具有特定功能的蛋白的指令。但是在一項新的研究中,美國耶魯大學醫學院免疫學家Richard Flavell及其團隊發現幾個蛋白編碼基因被錯誤識別為非蛋白編碼的,特別地,其中的一個基因在免疫系統中發揮關鍵作用。相關研究結果于2018年12月12日在線發表在Nature期刊上,論文標題為“The translation of non-canonical open reading frames controls mucosal immunity”。

這些研究人員猜測對在基因組中的基因進行注釋或分類的方式限制了對具有編碼蛋白潛力的基因的鑒定。為了測試這一猜測,他們使用小鼠模型來研究RNA和核糖體之間的相互作用,其中核糖體是將RNA轉化為蛋白的微小結構。他們還使用了一種稱為核糖體分析(ribosome profiling)的技術來研究核糖體如何與RNA存在關聯。通過將多種技術結合在一起,他們發現了多個之前被鑒定為非蛋白編碼的基因積極地表達蛋白。


在進一步的實驗中,這些研究人員著重專注于一個這樣的基因:Aw112010:當小鼠被細菌感染時,這個基因就被激活。通過使用CRISPR基因編輯,他們證實免疫細胞強有力地合成由Aw112010基因表達的蛋白來應對沙門氏菌感染。


這些研究結果表明人們可能還會發現更多的蛋白編碼基因和功能。論文**作者Ruaidhri Jackson 說,“一大部分重要的蛋白編碼基因因基因組注釋而被遺漏掉。”在沒有研究和識別出這些基因的情況下,“我們無法完全理解蛋白編碼基因組,也無法充分地為了健康和疾病目的開展基因篩選。”