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將多個(gè)基因錯(cuò)誤識(shí)別為非蛋白編碼的

2018-12-18 09:24來源：生物谷


人類基因組包含編碼蛋白的區(qū)域，這意味著它們具有產(chǎn)生在體內(nèi)具有特定功能的蛋白的指令。但是在一項(xiàng)新的研究中，美國耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)家Richard Flavell及其團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)幾個(gè)蛋白編碼基因被錯(cuò)誤識(shí)別為非蛋白編碼的，特別地，其中的一個(gè)基因在免疫系統(tǒng)中發(fā)揮關(guān)鍵作用。相關(guān)研究結(jié)果于2018年12月12日在線發(fā)表在Nature期刊上，論文標(biāo)題為“The translation of non-canonical open reading frames controls mucosal immunity”。

這些研究人員猜測(cè)對(duì)在基因組中的基因進(jìn)行注釋或分類的方式限制了對(duì)具有編碼蛋白潛力的基因的鑒定。為了測(cè)試這一猜測(cè)，他們使用小鼠模型來研究RNA和核糖體之間的相互作用，其中核糖體是將RNA轉(zhuǎn)化為蛋白的微小結(jié)構(gòu)。他們還使用了一種稱為核糖體分析（ribosome profiling）的技術(shù)來研究核糖體如何與RNA存在關(guān)聯(lián)。通過將多種技術(shù)結(jié)合在一起，他們發(fā)現(xiàn)了多個(gè)之前被鑒定為非蛋白編碼的基因積極地表達(dá)蛋白。


在進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)中，這些研究人員著重專注于一個(gè)這樣的基因：Aw112010：當(dāng)小鼠被細(xì)菌感染時(shí)，這個(gè)基因就被激活。通過使用CRISPR基因編輯，他們證實(shí)免疫細(xì)胞強(qiáng)有力地合成由Aw112010基因表達(dá)的蛋白來應(yīng)對(duì)沙門氏菌感染。


這些研究結(jié)果表明人們可能還會(huì)發(fā)現(xiàn)更多的蛋白編碼基因和功能。論文**作者Ruaidhri Jackson 說，“一大部分重要的蛋白編碼基因因基因組注釋而被遺漏掉。”在沒有研究和識(shí)別出這些基因的情況下，“我們無法完全理解蛋白編碼基因組，也無法充分地為了健康和疾病目的開展基因篩選。”