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新方法讓蛋白在非天然環境中保持活性

2018-03-23 13:32來源:生物谷

蛋白存在的問題是它們是非常挑剔的。將它們從它們的天然環境中移除,它們可能會降解。 為了正常地發揮功能,蛋白必須折疊成特定的結構,而且這種折疊通常需要其他蛋白的幫助。 為了克服這一挑戰,來自美國加州大學伯克利分校 的Ting Xu教授及其團隊分析了蛋白序列和表面的趨勢,以便觀察他們是否能夠開發一種合成聚合物,其中這種合成聚合物會提供蛋白保持它的結構和功能所需的所有一切。


Xu團隊構建出隨機異源聚合物(random heteropolymer, RHP)。RHP由四種類型的單體亞單位(monomer subunit)組成,每種單體亞單位具有與感興趣的蛋白表面上的化學片段相互作用的化學性質。這些單體亞單位相互連接在一起來模擬天然的蛋白,從而使得它們與蛋 白表面之間的相互作用的靈活性**化。因此,RHP起著經常在細胞內觀察到的非結構化蛋白的作用。它們在蛋白翻譯期間增加膜蛋白在水中的折疊,并且保持水溶性蛋白質有機溶劑中的活性。相關研究結果發表在2018年3月16日的Science期刊上,論文標題為“Random heteropolymers preserve protein function in foreign environments”。

在這項研究中,來自美國西北大學的研究人員進行了大量的分子模擬研究來證實RHP順利地與蛋白表面相互作用,在有機溶劑中包裹在蛋白表面上,在水中微弱地包裹在蛋白表面上,從而導致在非天然環境中產生正確的蛋白折疊和穩定性。


這些研究人員隨后測試了他們是否能夠利用RHP制造出基于蛋白的用于對有毒化學物質進行生物修復的材料。他們將RHP與一種被稱作有機磷水解酶(organophosphorus hydrolase, OPH)的蛋白混合在一起。OPH能夠降解在殺蟲劑和化學戰劑中發現的有毒性的有機磷。


這些研究人員利用RHP和OPH制造出纖維墊(fiber mat),將這些纖維墊浸入到一種眾所周知的殺蟲劑溶液中,結果發現這些纖維墊在幾分鐘內降解的這種殺蟲劑數量大約相當于纖維墊總重量的十分之一。他們表示,這種方法應當可適用于其他的酶。