單細胞測序平民化，測一個細胞僅需一美分，一次能測上千個細胞！

來自艾倫學院和華盛頓大學的科學家們開發出了一種廉價的高級技術可以檢測成百上千個細胞的基因表達。這項基于配位的轉錄組測序技術（Split Pool Ligation-based Transcriptome sequencing，SPLiT-seq）是一項可延展的用于表征單個細胞RNA水平的技術，可用于鑒定腦部疾病及其他組織中的不同細胞類型，這項研究于近日發表在《Science》上。

“研究任何的多細胞生物系統，我們都需要明白它的基本組件——細胞。”艾倫學院科學家Bosiljka Tasic說道。“大腦包含很多不同形狀和大小的細胞，但是現在卻沒有一種方法可以表征它們并進行分類。在單細胞水平鑒定RNA是一種鑒定細胞的方法，但是現有的技術太昂貴，且需要特殊的設備。由于SPLiT-seq可以通過任何實驗室的基礎設備完成，因此它將廣泛應用于單細胞轉錄組學研究。”

過去開發的測序技術需要在進行基因標記之前分離單個細胞。而采用SPLiT-seq就不需要再分離細胞了。取而代之的是，細胞本身就被作為了一個自身RNA的分離器。研究人員可以同時將大量細胞進行RNA標記，這個過程需要重復多次，以保證每個細胞都具有一組獨特的組合標簽。這使得研究人員可以同時對大量的細胞進行基因表達的測序，并將它們進行分類。

“在這個項目中，我們使用SPLiT-seq對正在發育的小鼠大腦和脊髓中超過150000個細胞進行了測序，我們發現了許多特殊細胞類型的新的分子標記物。”華盛頓大學電氣工程系合成生物學家、Paul G.Allen計算科學和工程學院Georg Seelig教授說道。“我們的實驗成本為每個細胞一美分。SPLiT-seq顯著降低了實驗室進行單細胞測序的障礙，同時不需要昂貴的特殊設備。”

“任何疾病，包括阿爾茲海默癥和帕金森，都起始于某些細胞的功能異常。”Tasic說道。“探索是哪些細胞以及哪些基因出錯將幫助我們更深入地了解這些疾病的起因及進程，有利于我們開發新的治療方法。”