肺臟共生微生物幫助治療呼吸道感染

最近，來自倫敦皇家學院的一位微生物專家撰文強調了肺臟微生物組對于促進我們理解與控制呼吸道感染的重要性。William Cookson是皇家國立心臟與肺臟研究所的一名教授，在他寫的《Nature Reviews Microbiology》文章中，他解釋了我們應當如何通過對肺臟微生物組進行研究，從而提高對肺臟感染的控制以及避免細菌產生耐藥性。

肺臟感染是現如今世界上致死率最高的疾病之一，但相比于其它部位的感染而言，其診斷與治療的進展一直十分緩慢。特別地，我們最近才剛剛開始通過DNA測序的手段鑒定呼吸道的細菌與真菌的類型。

這篇文章則重點強調了其中的問題，而且展示了現代微生物組學技術對于提高肺臟疾病的預防與治療效果的作用。

直到目前為止，科學家們錯誤地認為肺臟與呼吸道是無菌的環境，人類微生物組學計劃以及相關的研究都無視了肺臟組織。如今，我們知道呼吸道表面有很多微生物種群，即肺臟微生物組，與皮膚與腸道上部相似。此外，我們也知道常見的疾病，例如慢性肺病都會破壞腸道的微生物穩態。

對于研究肺臟微生物組來說，最嚴峻的挑戰在于獲得樣本，受試者可以通過咳嗽提交樣本，醫生們也可以通過向肺部插入微型的試管用于采樣。然而，由于肺臟中存在大量的細胞，因此細胞內源的DNA會造成很高的背景干擾，使得細菌DNA信號難以被檢測到。

檢測結果表明，每個健康個體中總共存在200種不同類型的細菌，而所有個體樣本總計囊括數千種細菌類型。

出生之后肺臟微生物即開始定植，兩年后將變得十分復雜與多樣化。而與其它生態系統類似，肺臟微生物種類的復雜性也會保護機體免受有害病原微生物的侵染。

生活環境往往會影響腸道微生物的構成，例如鄉村生活會促進肺臟微生物的多樣化發展，也會保護機體降低患哮喘以及過敏反應的風險。生活在城市中則會降低其物種多樣性，也會為病原體的入侵提供契機。

在我們的社會中，肺臟感染往往多發于哮喘或其它肺病患者中，常規的檢測手段往往需要培養細菌，這種手段需要耗時1到多天，但患者的診斷往往需要快速給出結果。

而一旦我們對引發肺病的微生物有了準確的認識，那么就能夠通過快速測序的手段鑒定上述微生物是否存在。此外，我們還能夠估計其數量，威脅性以及對抗生素的耐受性等等等。隨著診斷技術的進步，我們就能夠靶向有害的微生物，同時不會對益生菌產生影響。最終，我們能夠通過給患者接種肺臟益生菌緩解患者的病情嚴重程度。